Station Nijkerk werd als onderdeel van de spoorlijn Amersfoort-Kampen in 1863 opgeleverd. De volledige spoorlijn werd in 1866 geopend.
Alle stations langs deze lijn waren gestandaardiseerd en symmetrisch opgezet. Zij werden ingedeeld in drie klassen. Nijkerk behoorde tot de eerste klasse: de meer voorname en grotere gebouwen.
